Тема Тантры в среде натха-йогинов довольно деликатная. Возможности тантрических практик имеют очень широкий диапазон применения – от мантр для повседневных действий и джапы до развитых ритуалов. В традиции совсем не принято обучение тантрическим практикам, если ученик не обладает в достаточной мере опытом  йоги. Или попросту не имеет достаточной степени отрешённости и способности «не увязнуть» в мирских амбициях. Гуру традиции очень внимательны, как и кому передаются методы Тантры. В первую очередь, натха-йогины, опираются на йогу и принципы ямы-ниямы, и Тантра для них является только средством получения определённого мистического опыта. Если Гуру посчитает, что ученику необходимо получить такой опыт, тогда ученик получит какие-то передачи для практики, но если Гуру видит не готовность или не возможность для ученика следовать этим путём, — значит нет. Фактически натхизм пронизан идеями Тантры о макрокосме и микрокосме. Множественность форм свойственная другим тантрическим линиям, замещена или отождествляется с йогическими архетипами и образами девяти обожествляемых йогинов.  Это ведущие ориентиры тантрического мировоззрения натхов. Каждый из этих девяти йогинов олицетворяет разные силы во Вселенной и представлен и в макрокосмической структуре, и в структуре микрокосма. Именно постижение свойств девяти натхов и есть тот самый опыт познавания трансцендентной реальности через множественность форм. Также в традиции имеют применение и некоторые формы шактийских практик, которые представлены через аспект Йогамайя Бала Сундари. Именно этот аспект Шакти, по мнению натха-йогинов, является консолидирующим все остальные проявления Шакти. Пожалуй, можно сказать, что именно эти два направления тантрических идей стали основными направлениями тантризма натхов. Обычно, особенности взглядов, идей и садханы Тантры, в полной мере раскрывает только Гуру, который и сам должен иметь достаточный опыт и сформировавшийся взгляд на понимание и Тантры, и йоги натха-йогинов. Тогда у ученика есть шанс полноценно следовать целям Пути йогина.